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基于线粒体COI及核糖体ITS序列分析的中国尼氏真绥螨自然种群遗传多样性研究.pdf
尼氏真绥螨作为在我国南部广泛分布的捕食螨，是许多种害螨的重要天敌。本研究中，COI和ITS被用来研究尼氏线个地理种群间的遗传分化。我们首先检测了中国尼氏自然种群核苷酸变异的水平和模式，探明了这些种群间是否有遗传分化。最后，我们还评价了DNA序列数据研究种群遗传的实用性。主要结论如下1COI片段长度为658BP，共有46个多态性位点，将全部序列分类为33个单倍型。序列AT碱基含量较高，变化范围为654％到665％。COI基因的核酸多样性NUCLEOTIDEDIVERSITY，Π以及单倍型多样性HAPLOTYPEDIVERSITY，HD较高，变化范围分别为00034到00111和0385到0809。多样性较高的为重庆Π01111HD0809和广州种群Π001022HD0788。TAJIMASTEST检测显示COI区域没有显著偏离中性平衡。西南种群中重庆拥有最多的单倍型（7个）。单倍型CH29分布频率最高，分布于五个种群。有单倍型与种群的特异性分布现象（单倍型CH02和CH03仅分布于成都种群，CH06和CH07仅分布于广州种群）。COI单倍型网状分支图比ITS复杂。2从145个样品成功扩增出了ITS，片段长度有648和649BP两种，共有16个多态性性位点，其中9个为转换（TRANSITION），6个为颠换TRANSVERSION，1个位点为缺失INDEL，将全部序列分为16个单倍型，其中有11个为私有单倍型。ITS序列总体的核酸多样性NUCLEOTIDEDIVERSITY，Π为000136。广州种群的ITS遗传多样性较低，只有1个单倍型被发现。成都种群的ITS遗传多样性较高Π000185，HD0803。TAJIMASTEST检测显示ITS区域负显著偏离中性平衡（TAJIMASD177962，P＜005）。IH02分布于所有种群，频率最高。有些单倍型只分布于特定种群，如IH05只分布于韶关种群，IH09、IH10、IH15只分布于成都种群。成都种群是异质性最高的种群，拥有6个单倍型。南宁和长沙种群次之，分别具有5个单倍型。ITS单倍型的网状图较为简单。单倍型间最多的碱基差异为2个。3多数种群间的FST值显示种群差异显著。COI区域的种群间的FST值变化区间是003858（武汉南平）到071485（成都韶关）。ITS区域的种群间的FST值变化区间是004776（南平长沙）到042424（南平广州）。从COI序列得到的FST值明显高于ITS。在长沙、武汉、南平种群间没有显著性差异（除了武汉长沙，基于COI序列）。在COI区域，种群间的FST/1FST值与地理距离显著正相关R0303，P0047，而ITS种群间FST/1FST与地理距离没有显著相关性ITSR0011，P0441。我们对比了基于COI和ITS序列的NJ法构建的进化树和PCA分析结果COIPC13374％，PC22174％ITSPC17453％，PC21584％，显示尼氏线个分支。
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